Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5934D3Z4U6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5934D3Z4U6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms