Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pdzd8B9EJ80 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pdzd8B9EJ80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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