Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Zbed5B2RPU8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Zbed5B2RPU8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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