Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm12A2AJ77 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms