Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm27029A2A4P4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm27029A2A4P4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms