Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl40Q9Z2Q5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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