Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mbd3Q9Z2D8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mbd3Q9Z2D8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms