Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog1Q9Z160 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms