Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clip2Q9Z0H8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clip2Q9Z0H8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms