Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Wdr54Q9R0D8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms