Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Copg1Q9QZE5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copg1Q9QZE5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms