Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nr2e3Q9QXZ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms