Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Limd1Q9QXD8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Limd1Q9QXD8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Limd1Q9QXD8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Limd1Q9QXD8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Limd1Q9QXD8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Limd1Q9QXD8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Limd1Q9QXD8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Limd1Q9QXD8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Limd1Q9QXD8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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