Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Trappc2lQ9JME7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Trappc2lQ9JME7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms