Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SrfQ9JM73 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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