Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod2Q9JKK7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tmod2Q9JKK7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod2Q9JKK7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Tmod2Q9JKK7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tmod2Q9JKK7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Tmod2Q9JKK7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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