Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf2ird1Q9JI57 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms