Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim39Q9ESN2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim39Q9ESN2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trim39Q9ESN2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trim39Q9ESN2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim39Q9ESN2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms