Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp29Q9ES63 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp29Q9ES63 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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