Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms