Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde1Q9DBZ9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syde1Q9DBZ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms