Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cab39lQ9DB16 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cab39lQ9DB16 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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