Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc89Q9DA73 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms