Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms