Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Tmco5aQ9D9D5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmco5aQ9D9D5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmco5aQ9D9D5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmco5aQ9D9D5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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