Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms