Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms