Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms