Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc7Q9D541 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc7Q9D541 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms