Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl28Q9D1B9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms