Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Snx7Q9CY18 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx7Q9CY18 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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