Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Xrcc3Q9CXE6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms