Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NubplQ9CWD8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms