Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smurf1Q9CUN6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smurf1Q9CUN6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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