Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rprd1bQ9CSU0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rprd1bQ9CSU0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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