Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Higd1bQ99JY6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms