Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TirapQ99JY1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TirapQ99JY1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TirapQ99JY1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TirapQ99JY1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TirapQ99JY1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TirapQ99JY1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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TirapQ99JY1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TirapQ99JY1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms