Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdelr1Q99JH8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms