Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan1Q99J59 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms