Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PdgfdQ925I7 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PdgfdQ925I7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfdQ925I7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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PdgfdQ925I7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PdgfdQ925I7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PdgfdQ925I7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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