Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Csmd1Q923L3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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