Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp3Q91W36 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Usp3Q91W36 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Usp3Q91W36 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp3Q91W36 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp3Q91W36 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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