Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ApofQ91V80 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms