Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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