Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rprd1aQ8VDS4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rprd1aQ8VDS4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms