Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stn1Q8K2X3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms