Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Znf628Q8CJ78 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf628Q8CJ78 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Znf628Q8CJ78 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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