Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx8Q8CFD4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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