Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms