Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc87Q8CDL9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc87Q8CDL9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms